《神农本草经百种录》，药学著作。一卷。清·徐大椿撰。刊于1736年。本书选辑《神农本草经》中主要药物100种，结合临床加以简要的注释。现有《徐灵胎医学全书》等刊本。
《神农本草经百种录》里历代《本经》注疏中偏重阐发古本草药性机理与用药规律的临床指导著作。《神农本草经百种录》从临床药用实效出发，推原古本草学用药物偏性纠正人体阴阳气血之偏，使其返平的用药思路，本着阴阳五行、取象比类的象数思维，阐注《本经》药物四气五味、主治功效，并融会《内经》《伤寒》《金匮》之精义于《本经》注解、发凡之中，昭示《本经》常用药物药性机理与用药规律，为后世医家叩开本草学大门，留下了发蒙解惑、拨迷归正的引航之灯。